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1.裸藻有趨光性，在太陽光特別強烈的時候，或是在早上非常清爽的時候，它可能滿塘都是，因為它繁殖得非常快，一下子整個池塘都布滿了。當天氣變化的時候呢，他可能就消失得特別多，這是它非常大的一個特點。裸藻有趨光性，而藍藻沒有那么明顯。
2.裸藻絕大部分集中在水體的表面，集中在水體的表層，把表層水用手或竹竿給它拋開，下面的水很清澈。而藍藻水，當拋開水的時候，明顯看到，水下5~10cm，它的顏色都是很相近的顏色，不會有那么大的差別。
3.裸藻集中的時候面上會起泡，用手一抓，它會粘在手上，有粘性。而藍藻沒那么明顯。
裸藻大量出現后，雖然本身沒有毒素，但是數量增多會抑制生長。可以在白天多開增氧機，能減少裸藻的出現，也可以用復合芽孢桿菌抑制裸藻生長。或者也可以用殺藻類的產品，來達到去除大量裸藻的作用。裸藻的出現一般是因為用肥不當，所以平時不建議使用未發酵的有機肥。
